Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms