Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 578.7 ms