Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms