Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms