Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms