Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cttnbp2B9EJA2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cttnbp2B9EJA2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms