Protein–RNA interactions for Protein: B8JJD6

Fance, Fanconi anemia, complementation group E, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanceB8JJD6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FanceB8JJD6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FanceB8JJD6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FanceB8JJD6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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