Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam71aB7XG49 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms