Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms