Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rd3lB2RV38 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rd3lB2RV38 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rd3lB2RV38 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rd3lB2RV38 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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