Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rrn3B2RS91 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Rrn3B2RS91 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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