Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Uhrf1bp1B2KF50 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf1bp1B2KF50 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms