Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trabd2bB1ATG9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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