Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spocd1B1ASB6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms