Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms