Protein–RNA interactions for Protein: B1AQB1

Gm11569, Predicted gene 11569, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11569B1AQB1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gimap1os-201ENSMUST00000155906 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Atcayos-201ENSMUST00000129834 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm11569B1AQB1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms