Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm3173A6NAS3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm3173A6NAS3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm3173A6NAS3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm3173A6NAS3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm3173A6NAS3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm3173A6NAS3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm3173A6NAS3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3173A6NAS3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms