Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms