Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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