Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Frmpd1A2AKB4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms