Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc183A2AJB1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms