Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms