Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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