Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms