Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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