Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms