Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cib2Q9Z309 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cib2Q9Z309 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cib2Q9Z309 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cib2Q9Z309 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cib2Q9Z309 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cib2Q9Z309 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cib2Q9Z309 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cib2Q9Z309 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cib2Q9Z309 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms