Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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Hdac6Q9Z2V5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac6Q9Z2V5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac6Q9Z2V5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac6Q9Z2V5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac6Q9Z2V5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac6Q9Z2V5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Hdac6Q9Z2V5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Hdac6Q9Z2V5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hdac6Q9Z2V5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac6Q9Z2V5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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