Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3Q9Z2D8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms