Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms