Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms