Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VarsQ9Z1Q9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VarsQ9Z1Q9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms