Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms