Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme4Q9WV84 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms