Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms