Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim10Q9WUH5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms