Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn4Q9WU22 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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