Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp18Q9WTV6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp18Q9WTV6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp18Q9WTV6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp18Q9WTV6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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