Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms