Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt71Q9R0H5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms