Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr54Q9R0D8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms