Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms