Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms