Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms