Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms