Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms