Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms