Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Six6Q9QZ28 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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