Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plxnb3Q9QY40 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms