Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms